土壤生物主要由土壤动物、微生物、植物三部分组成。

1、土壤动物：脊椎动物、节肢动物、环节动物、软体动物。第二类中型动物，例如，螨、弹尾目昆虫等节肢动物，蠕虫等环节动物。

2、土壤微生物：包括细菌、放线菌、真菌、病毒，以及藻类、地衣、苔藓等。广义的土壤生物还包括土壤中的一些活性有机体，如植物根系、块茎、种子及昆虫的卵和蛹等。

3、植物：包含了如树木、灌木、藤类、青草、蕨类，及绿藻、地衣等熟悉的生物。植物可以分为种子植物、苔藓植物、蕨类植物等。