石申的主要贡献在于天文学方面，著有《天文》八卷，西汉以后此书被尊为《石氏星经》、《浑天图》等，《甘石星经》在中国和世界天文学史上都占有重要地位。

石申曾系统地观察了金、木、水、火、土五大行星的运行，发现其出没的规律，记录名字，测定了121颗恒星方位，数据被后世天文学家所用。石申、甘德的研究成果为历代天文星相家所重视，在正史的天文志类中，引用了他们大量的研究成果。