1、投资标的不同：货币基金投资于货币市场工具(一年以内)，而债券基金投资于债券，可以是长期债券也可以是短期债券。

2、获利方式不同：货币基金的盈利来源于利息，而债券基金的收益主要来源于债券价格的上涨。

3、风险不同：货币基金投资于货币市场工具，这些工具由信用度极高的机构发行，因此货币基金很难亏损。债券基金容易受到市场利率的影响，市场利率如果大幅上涨，债基的净值就会下跌。