吕不韦迁蜀的原因是吕不韦引起秦王的忌恨，他长期贪恋权势，他所推荐的门客嫪毐，和太后赵姬淫乱后宫，使得秦王嬴政以及整个秦国蒙羞，秦王对于吕不韦十分忌惮。

吕不韦勾结六国宾客，可能会出卖秦国利益，吕不韦已经放弃权力，但是手底下的门客却跃跃欲试，想要四处奔走谋取权利，猜疑心重的嬴政，心怀不满，特意让李斯前去责罚，将吕不韦以及家人迁徙到蜀地。