1、经济适用房享受一定的优惠政策，土地实行划拨，建设和经营中的行政事业性收费减半收取，而商品房土地实行出让，没有收费优惠；
2、经济适用房销售对象受限制，必须是本市城镇居民的中低收入家庭，并经过经济适用房管理部门进行购买资格审核，而商品房没有此项限制；
3、经济适用房在上市交易时受限制，需在取得房产证五年后，才可上市交易。出售时应当按照规定缴纳有关税费，并交纳土地出让金，不得再次购买经济适用房；而商品房在取得房产证后，即可上市交易，购买次数不受限制，也无需缴纳土地出让金。